Towards tripartite long distance RNA interference: sRNAs in Trichoderma-Arabidopsis-Botrytis interactions

dc.catalogadorpva
dc.contributor.advisorLarrondo Castro, Luis Fernando
dc.contributor.authorPérez Lara, Rodrigo Esteban
dc.contributor.otherPontificia Universidad Católica de Chile. Facultad de Ciencias Biológicas
dc.date2025-03-15
dc.date.accessioned2024-03-18T13:39:39Z
dc.date.updated2024-03-13T17:50:18Z
dc.descriptionTesis (Doctor en Ciencias Biológicas mención Genética Molecular y Microbiología)--Pontificia Universidad Católica de Chile, 2024
dc.description.abstractLa necesidad de alternativas a uso de pesticidas químicos para controlar a los fitopatógenos fúngicos se ha hecho patente en las últimas décadas, despertando el interés en el estudio de organismos biocontroladores para entender y explotar sus capacidades. Entre estos, el hongo T. atroviride destaca por su capacidad micoparasitaria y sus efectos beneficos para las plantas, promoviendo su crecimiento, el fortalecimiento de la respuesta inmunológica y otorgándoles mayor tolerancia frente a fitopatógenos. Por otro lado, nuevas técnicas de biocontrol como HIGS o SIGS, que dependen de la capacidad de los organismos para capturar y procesar sRNAs para silenciar genes, han mostrado buenos resultados. Si bien estas metodologías son prometedoras, se ven limitadas por los costos de producción de los RNA o las restricciones para la manipulación genética de las plantas. Estos organismos pueden mover sRNAs de manera intrínseca, utilizando dichas moléculas como señales para de desarrollo, crecimiento y defensa. El movimiento bidireccional de RNA entre reinos se ha descrito en contextos de infección, como un diálogo que comprende ataque-defensa entre las plantas y fitopatógenos tales como B. cinerea. Esto ha despertado el interés por determinar la viabilidad de este fenómeno en otras interacciones plantahongo. Recientemente, se han reportado algunos trabajos que resaltan la existencia y relevancia de los sRNAs en la interacción de plantas con microorganismos no patógenos. Dado que el genoma de T. atroviride codifica una maquinaria sRNA funcional y que el origen de su capacidad para generar efectos benéficos en plantas es desconocido, decidimos investigar la contribución de esta maquinaria en dicho contexto. Por lo tanto, este trabajo tiene como objetivo evaluar el papel de la maquinaria de sRNA en las interacciones entre T. atroviride y A. thaliana, incluyendo cuando la planta es infectada con B. cinerea y determinar el movimiento de sRNAs entre Trichoderma-Arabidopsis y Trichoderma-Botrytis.Utilizando cepas mutantes de Trichoderma en los genes Dicer-like 1, Dicer-like 2 o Argonauta 2, determinamos que la maquinaria de sRNAs es relevante en el crecimiento de la planta durante interacciones directas e indirectas Trichoderma-Arabidopsis. También son importantes para la inducción de las defensas de la planta y su relevancia varía con el uso de fertilizantes. Por otro lado, utilizando cepas que sobreexpresan hpRNAs contra genes de otros organismos, evaluamos la capacidad de T. atroviride para enviar RNAs a A. thaliana y B. cinerea. Con un reportero GFP, encontramos evidencia parcial de movimiento localizado de sRNAs producidos por Trichoderma hacia la punta de la raíz, pero no en todo el tejido radicular de Arabidopsis. Cuando ambos hongos se enfrentaron, encontramos una cepa mutante de hpRNA con un aumento en la capacidad micoparasitica. Esta tesis es el puntapié inicial para el estudio de los sRNAs de T. atroviride en sus interacciones benéficas y su implementación como una herramienta biotecnológica.
dc.description.funderANID/Fondecyt
dc.description.version2025-03-15
dc.fechaingreso.objetodigital2024-03-13
dc.format.extent108 páginas
dc.fuente.origenAutoarchivo
dc.identifier.doi10.7764/tesisUC/BIO/84578
dc.identifier.urihttps://doi.org/10.7764/tesisUC/BIO/84578
dc.identifier.urihttps://repositorio.uc.cl/handle/11534/84578
dc.information.autorucFacultad de Ciencias Biológicas; Larrondo Castro, Luis Fernando; 0000-0002-8832-7109; 3629
dc.information.autorucFacultad de Ciencias Biológicas; Pérez Lara, Rodrigo Esteban; S/I; 1050269
dc.language.isoen
dc.nota.accesocontenido completo
dc.rightsacceso abierto
dc.subject.ddc570
dc.subject.deweyBiologíaes_ES
dc.titleTowards tripartite long distance RNA interference: sRNAs in Trichoderma-Arabidopsis-Botrytis interactions
dc.typetesis doctoral
sipa.codpersvinculados3629
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