Browsing by Author "Urdaneta Álvarez, Luis Daniel"

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    Análisis de la Melanosis Focal en Salmón del Atlántico (Salmo salar): una aproximación al perfil de expresión génica de la respuesta inmune y homeostasis celular
    (2025) Urdaneta Álvarez, Luis Daniel; Escobar Aguirre, Sebastián Gonzalo; Pontificia Universidad Católica de Chile. Facultad de Agronomía y Sistemas Naturales
    La melanosis focal (MF), es una condición que se presenta como una pigmentación anómala en el músculo esquelético del salmón del Atlántico (Salmo salar), también conocida como Manchas Negras. Esta condición se caracteriza por la acumulación de pigmento melánico en células inmunes, conocidas como melanomacrófagos. Aunque su etiología es multifactorial y no se considera una enfermedad infecciosa per se, representa un desafío significativo para la industria acuícola, dado su impacto negativo en la calidad del producto y las consecuentes pérdidas económicas. A pesar de su importancia, el conocimiento sobre la patogénesis de la MF a nivel molecular es incipiente. Por lo tanto, este estudio se propuso investigar la base molecular de esta patología, con el objetivo de identificar y validar la expresión de genes clave relacionados con la respuesta inmune y la homeostasis celular.Se analizaron muestras de músculo esquelético de salmones con y sin melanosis, provenientes de agua dulce y agua de mar. Mediante el uso de secuenciación de RNA (RNA-seq), se identificó un perfil de expresión génica que reveló que la melanosis focal induce una alteración drástica en el paisaje transcriptómico del tejido. Específicamente, el análisis bioinformático de los genes diferencialmente expresados (DEGs) demostró una clara activación de la respuesta inmune innata y la inflamación, con el enriquecimiento de términos funcionales como "respuesta celular a lipopolisacárido" y "respuesta inflamatoria". En contraste, se observó una represión de vías de metabolismo y homeostasis celular, incluyendo la vía de la autofagia y la de señalización de la insulina. Esta clara segregación de los perfiles de expresión génica entre los grupos con y sin melanosis, confirmada por el análisis de componentes principales (PCA), establece que la melanosis no es un fenómeno superficial, sino una condición con un impacto sistémico a nivel molecular. Posteriormente, se realizó una validación de los hallazgos por PCR en tiempo real (qPCR) para cuatro genes de interés: CR1, Autofagia, Autofagia 04041 y Señalización de Insulina, utilizando la β-actina como gen de referencia. Los resultados de qPCR no revelaron diferencias estadísticamente significativas en la expresión de los genes analizados entre los grupos con y sin melanosis. Este hallazgo, se atribuye a la alta variabilidad biológica de las muestras y al tamaño de muestra limitado. A pesar de esto, el gen CR1 mostraron una tendencia de sobreexpresión en las muestras con melanosis, lo que sugiere una posible activación del sistema inmune en respuesta a la patología.