Browsing by Author "Larraín Correa, Juan Agustín"

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    A role for Lin-28 in growth and metamorphosis in Drosophila melanogaster
    (2018) Gonzalez-Itier, Sergio; Contreras, Esteban G.; Larraín Correa, Juan Agustín; Glavic, Alvaro; Faunes Quinteros, Fernando Emerson
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    Análisis de los cambios tempranos del transcriptoma en respuesta al daño en la médula espinal de Xenopus laevis.
    (2019) Peñailillo Lazo, Johany Freddy; Larraín Correa, Juan Agustín; Pontificia Universidad Católica de Chile. Facultad de Ciencias Biológicas
    A diferencia de los mamíferos, otros animales como las larvas de anfibios anuros (donde se incluye a Xenopus) pueden lograr una recuperación funcional completa después de una lesión en la médula espinal. En nuestro laboratorio, se ha establecido a la rana Xenopus laevis (X. laevis) como un organismo modelo para estudiar la regeneración de la médula espinal. Una de las principales ventajas de X. laevis es que las larvas en etapas 50-54 (estadios-R) pueden recuperarse anatómica, histológica y funcionalmente después de una lesión en la médula espinal (LME). Esas habilidades se pierden por completo en las ranas juveniles (estadio-NR). La zona ependimaria del canal central de la médula espinal de las larvas en estadios-R presenta un alto porcentaje de células progenitoras neuronales (NPC) Sox2+. Estas se activan rápidamente en respuesta a una lesión y son necesarias para lograr la regeneración completa de la médula espinal. Nuestro interés es identificar las redes genéticas y las vías de señalización involucradas en la activación temprana de NPC. Para identificar los mecanismos y las vías de señalización involucradas en la activación de células Sox2+, hemos realizado un análisis de los cambios del transcriptoma durante las primeras 21 horas posteriores a la transección (hpt) en animales en estadios-R. Con este objetivo, el tejido del sitio de la lesión se aisló cada 1 hora luego de la lesión en animales transectados, así como también en animales control, con daño simulado (sham) y sin daño. Como resultado de este muestreo y posterior secuenciación de ARNm conseguimos más de 100 librerías de RNA-seq, con las cuales se realizó un exhaustivo análisis bioinformático. Los genes expresados diferencialmente (GEDs) se identificaron mediante Procesos Gaussianos. Posteriormente, la estructura modular de los GEDs se infirió utilizando un Análisis de redes de Co-expresión Génica Ponderada (WGCNA). Estos módulos de co-expresión fueron analizados buscando procesos biológicos y vías de señalización KEGG enriquecidas. Además, analizamos los motivos de unión al ADN de factor de transcripción enriquecidos en el promotor proximal de genes coexpresados y las interacciones proteína-proteína entre los GEDs. Identificamos 1850 GEDs que se agruparon en 11 módulos de coexpresión (3 regulados negativamente, 2 regulados positivamente con una activación inmediata, 3 regulados positivamente con una activación intermedia y 3 regulados positivamente con una activación tardía). El análisis de ontología génica reportó: (1) un enriquecimiento de los reguladores negativos de la señalización mTOR en los primeros módulos regulados negativamente, (2) un aumento en factores de transcripción en los módulos de activación inmediata, (3) un aumento en los componentes de la biogénesis del ribosoma en módulos de activación intermedia y (4) un aumento en genes asociados a división de células progenitoras y de ciclo celular en módulos de activación tardía. En base a nuestros análisis bioinformáticos decidimos estudiar el rol de la vía mTOR durante las primeras horas luego de la transección. Análisis por Western Blot e Inmunofluorescencia contra p-S6, la forma activa de un componente intracelular de la vía mTOR, mostraron una activación rápida a las 3 hpt y principalmente en las células de la zona ependimaria del canal central cercanas al sitio de la lesión y los cuerpos neuronales a lo largo del sistema nervioso. La inhibición de esta vía de señalización utilizando rapamicina bloquea la proliferación de células Sox2+ y la recuperación funcional después de la LME. Estos resultados sugieren un papel clave para la vía mTOR en la rápida activación de las células Sox2+ para una adecuada recuperación después de la LME en renacuajos. De esta manera, podemos concluir que identificamos cambios tempranos en el transcriptoma de la médula espinal en respuesta al daño a la médula espinal, los cuales pueden ser asociados a varios procesos biológicos y vías de señalización que se despliegan en ondas transcripcionales secuenciales después de la LME. Finalmente, análisis bioinformáticos y pruebas funcionales de la vía mTOR sugieren que esta vía de señalización sería clave durante las primeras horas de la regeneración de la médula espinal.
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    Cellular composition and organization of the spinal cord central canal during metamorphosis of the frog Xenopus laevis
    (2018) Edwards-Faret, Gabriela; Cebrian-Silla, Arantxa; Mendez-Olivos, Emilio E.; Gonzalez-Pinto, Karina; Manuel Garcia-Verdugo, Jose; Larraín Correa, Juan Agustín
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    Characterization of spinal cord damage based on automatic video analysis of froglet swimming
    (2019) De Vidts, S.; Mendez-Olivos, E.; Palacios, M.; Larraín Correa, Juan Agustín; Mery Quiroz, Domingo
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    Conservation in the involvement of heterochronic genes and hormones during developmental transitions
    (2016) Faunes Quinteros, Fernando Emerson; Larraín Correa, Juan Agustín
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    Cornifelin expression during Xenopus laevis metamorphosis and in response to spinal cord injury
    (2022) Torruella González, Sol; Larraín Correa, Juan Agustín; Pontificia Universidad Católica de Chile. Escuela de Medicina
    Xenopus laevis tiene la capacidad de regenerar luego de un daño en sus estadios larvales (NF50), pero al término de la metamorfosis pierde esta capacidad (NF-66). En una secuenciación de ARN de alto rendimiento, se analizaron los transcritos de animales NF-50 y NF-66, 21 horas, 2 y 6 días luego del daño a la médula espinal por transección. Cornifelina fue uno de los transcritos más altamente expresados dos días después del daño en NF-66, lo que sugiere un rol luego del daño a la médula espinal. La expresión de cornifelina ha sido detectada previamente principalmente en epitelios escamosos estratificados como piel y mucosas, pero su expresión en estructuras del sistema nervioso central no ha sido descrita. Aquí, usando técnicas histológicas, moleculares y bioquímicas, reportamos la expresión de cornifelina en la médula espinal, en la retina y en la córnea de Xenopus laevis durante la metamorfosis; evaluamos la reacción meníngea luego del daño por transección de la médula espinal y caracterizamos una línea transgénica para cornifelina. La expresión de cornifelina fue detectada en la sustancia gris y meninges de la médula espinal de animales NF-50 y NF-66. La expresión en la sustancia gris disminuyó a lo largo de la metamorfosis. En retina, cornifelina fue detectada en la capa de células ganglionares, en las capas nucleares internas y externas y en el segmento externo en NF-50 y NF-66. Luego del daño a la médula espinal, la expresión de cornifelina fue regulada a la alta en animales NF-66. Además, encontramos que la expresión en meninges fue distinta luego del daño en NF-50 y NF66. En NF-50, células positivas para cornifelina fueron encontradas cerrando el sitio de daño un día luego de la transección. En los siguientes días, fue encontrada delineando el tejido nervioso en reconexión. Por otro lado, en NF-66, células positivas para cornifelina fueron encontradas en las meninges y en la porción ventral de la médula a los seis días luego del daño y en el sitio de daño a los diez días. Estos resultados sugieren que cornifelina participaría en la reacción meníngea luego del daño por transección a la médula espinal.
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    Desarrollo de la fijación simbiótica de nitrógeno en una cronosecuencia primaria en la Isla Santa Inés, Región de Magallanes, Chile
    (2013) Troncoso Aguilera, Paulina Andrea; Pérez Barrientos, Cecilia Antonieta; Larraín Correa, Juan Agustín; Ardiles, Victor
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    Heparan Sulfate Proteoglycans Exert Positive and Negative Effects in Shh Activity
    (2005) Carrasco, H.; Larraín Correa, Juan Agustín
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    JAK-STAT pathway activation in response to spinal cord injury in regenerative and non-regenerative stages of Xenopus laevis
    (2017) Tapia, V. S.; Herrera Rojas, Mauricio Alejandro; Larraín Correa, Juan Agustín
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    Lateral prefrontal activity as a compensatory strategy for defcits of cortical processing in Attention Deficit Hyperactivity Disorder
    (2017) Zamorano, F.; Billeke, P.; Kausel Kamp, Leonie Margarita; Larraín Correa, Juan Agustín; Stecher, X.; Hurtado, J.; López Hernández, Vladimir; Carrasco, X.; Aboitiz, Francisco
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    Quantitative Proteomics After Spinal Cord Injury (SCI) in a Regenerative and a Nonregenerative Stage in the Frog Xenopus laevis
    (2018) Lee Liu, Dasfne Nicole; Sun, Liangliang; Dovichi, Norman J.; Larraín Correa, Juan Agustín
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    Regeneration of Xenopus laevis spinal cord requires Sox2/3 expressing cells
    (2015) Muñoz, Rosana; Edwards Faret, Gabriela Andrea; Moreno Concha, Mauricio; Zuñiga, Nikole; Cline, Hollis; Larraín Correa, Juan Agustín
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    SHh activity and localization is regulated by perlecan
    (2011) Palma, V.; Carrasco Saavedra, Héctor Patricio; Larraín Correa, Juan Agustín
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    Spinal cord regeneration in Xenopus laevis
    (2017) Edwards Faret, Gabriela Andrea; Valle Muñoz Videla, Rosana del; Mendez Olivos, Emilio E.; Lee-Liu, Dasfne; Tapia, Victor S.; Larraín Correa, Juan Agustín
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    Spinal cord regeneration in Xenopus tadpoles proceeds through activation of Sox2-positive cells
    (2012) Gaete Carrasco, Marcia; Valle Muñoz Videla, Rosana del.; Sánchez, Natalia.; Tampe, Ricardo.; Moreno Concha, Mauricio; Contreras, Esteban G.; Lee Liu, Dasfne.; Larraín Correa, Juan Agustín
    Abstract Background In contrast to mammals, amphibians, such as adult urodeles (for example, newts) and anuran larvae (for example, Xenopus) can regenerate their spinal cord after injury. However, the cellular and molecular mechanisms involved in this process are still poorly understood. Results Here, we report that tail amputation results in a global increase of Sox2 levels and proliferation of Sox2+ cells. Overexpression of a dominant negative form of Sox2 diminished proliferation of spinal cord resident cells affecting tail regeneration after amputation, suggesting that spinal cord regeneration is crucial for the whole process. After spinal cord transection, Sox2+ cells are found in the ablation gap forming aggregates. Furthermore, Sox2 levels correlated with regenerative capabilities during metamorphosis, observing a decrease in Sox2 levels at non-regenerative stages. Conclusions Sox2+ cells contribute to the regeneration of spinal cord after tail amputation and transection. Sox2 levels decreases during metamorphosis concomitantly with the lost of regenerative capabilities. Our results lead to a working hypothesis in which spinal cord damage activates proliferation and/or migration of Sox2+ cells, thus allowing regeneration of the spinal cord after tail amputation or reconstitution of the ependymal epithelium after spinal cord transection.
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    Spinal cord regeneration: Lessons for mammals from non-mammalian vertebrates
    (2013) Lee Liu, Dasfne Nicole.; Edwards Faret, Gabriela Andrea; Larraín Correa, Juan Agustín